例のごとく、サーバのOSのアップデートを実施しました。
で、再起動の際にdjbdnsがまた（そう前回もだめだった）あがらなくて悩みましたが、/usr/local/etc/rc.d/svscan.sh にコメントがありましたよ、ありました。

rc.confなどにちゃんと書きなさいよ

って。
で、ちゃんと書いたので、再起動してもきちんとサービスが起動されるようになりました。
自宅サーバに独自ドメインもってきてるのに、こんな管理者ではダメダメですね。反省。